Генотипирование і Фенотипирование можа вызначыць і нават прадказаць, супраціў ВІЧ наркотыкаў
Нават для людзей з аптымальнай прыхільнасцю тэрапіі, у некаторай ступені лекавай устойлівасці ВІЧ, як чакаецца, развівацца з цягам часу з-за натуральных мутацый віруса. У іншых выпадках супраціў можа хутка развівацца , калі неаптымальнай захаванне дазваляе папуляцыя ВІЧ , устойлівай да квітнець, што прыводзіць у канчатковым выніку да неэфектыўнасці лячэння.
Калі адбываецца няўдача лячэння, альтэрнатыўныя камбінацыі лекавых сродкаў павінны быць абраныя для таго, каб здушыць гэтую новую папуляцыю ўстойлівага віруса.
Генетычнае тэставанне супраціву дапамагае палегчыць гэта шляхам вызначэння тыпаў ўстойлівых мутацый у чалавеку «вірусным пул» , а высвятленне , наколькі адчувальная гэтыя вірусы з'яўляюцца магчымымі антырэтравіруснымі прэпаратамі .
Два асноўнага інструмента выкарыстоўваецца для генетычнага тэставання супраціву ў галіне ВІЧ: Генатыпічная аналіз на ВІЧ і фенатыпічнае аналіз на ВІЧ.
Што такое генатып і фенатып?
Па вызначэнні, генатып проста генетычны склад арганізма, у той час як фенатып назіраныя характарыстыкі або рысы гэтага арганізму.
Генатыпічная аналізы (або генотипирование) функцыя шляхам ідэнтыфікацыі спадчынных інструкцый ўнутры генетычнага кадавання клеткі, або ДНК. Фенатыпічнае аналізы (або фенатыпу) пацвярджаюць экспрэсію гэтых інструкцый пад уздзеяннем розных умоў навакольнага асяроддзя.
У той час як асацыяцыя паміж генатыпам і фенатыпу не з'яўляецца абсалютнай, генотипирование часта можа быць прагнастычнай фенатып, у прыватнасці, калі змены ў генетычным кодзе надаваць чаканыя змены ў рысах або характеристике-, як у выпадку развіцця лекавай устойлівасці.
Фенотипирование, з другога боку, пацвярджае «тут і цяпер». Ён прызначаны для ацэнкі рэакцыі арганізма на канкрэтныя змены ў навакольным асяроддзі пад ціскам, такія як ВІЧ, калі падвяргаюцца ўздзеянню розных лекавых прэпаратаў і / або канцэнтрацыі прэпарата.
Тлумачачы генотипирования ВІЧ
ВІЧ генотипирование, як правіла, найбольш распаўсюджаная тэхналогія, выкарыстоўваная для тэставання супраціву.
Мэтай аналізу з'яўляецца выяўленне спецыфічных генетычных мутацый у кляп-Pol галіне віруса геному (або генетычнага кода). Гэта вобласць , дзе зваротнай транскриптазы, протеазы і интегразы ферменты-мішэні большасці антырэтравірусных прэпаратаў -Ёсць закадаваныя на ланцугу ДНК.
Да першай амплификации геному ВІЧ з дапамогай палімеразнай ланцуговай рэакцыі (ПЦР) тэхналогіі, лабарантаў могуць паслядоўна (ці «карта») генетыку віруса з выкарыстаннем розных тэхналогій выяўлення мутацый.
Дысертацыі мутацыя (або назапашванне мутацый) інтэрпрэтуюцца тэхнікамі , якія аналізуюць ўзаемасувязь паміж выяўленымі мутацыямі і вірусам чаканай успрымальнасцю да розных антырэтравіруснае прэпаратаў. Анлайнавыя базы дадзеных можа дапамагчы шляхам параўнання тэставай паслядоўнасці, што і прататып віруса «дзікага тыпу» (гэта значыць, ВІЧ , які не ўтрымлівае ўстойлівыя мутацыі).
Інтэрпрэтацыя гэтых тэстаў выкарыстоўваюцца для вызначэння адчувальнасці да лекаў, з вялікай колькасцю ключавых мутацый , якія надаюць да больш высокім узроўням лекавай устойлівасці .
Тлумачачы ВІЧ Phenoytyping
ВІЧ фенотипирования ацэньвае рост ВІЧ чалавека ў прысутнасці прэпарата, затым параўноўвае, што рост віруса кантрольнай, дзікага тыпу ў той жа прэпарат.
Як і Генатыпічная аналізаў, фенатыпічнае тэсты ўзмацняюць ванітавы-Pol вобласць геному ВІЧ.
Гэты падзел генетычнага кода, затым «прышчэплены» на клон дзікага тыпу з выкарыстаннем тэхналогіі рэкамбінантныя ДНК. Атрыманы рэкамбінантныя вірус выкарыстоўваюць для інфікавання клетак млекакормячых ў прабірцы (у лабараторыі).
Вірусны ўзор затым падвяргаюць ўздзеянню ня ўзрастаючых канцэнтрацый розных антырэтравірусных прэпаратаў да 50% і 90% падаўленне віруса дасягаецца. Канцэнтрацыі затым параўноўваюцца з вынікамі кантрольнай, дзікага тыпу ўзору.
Адносныя «фальцевання» змены забяспечваюць дыяпазон значэнняў, з дапамогай якога вызначаецца адчувальнасць да лекавых прэпаратаў. Змена чатыры разы проста азначае, што ў чатыры разы перавышае колькасць прэпарата, неабходнае для дасягнення зніжэння віруснай нагрузкі ў параўнанні з дзікім тыпам.
Чым больш раз значэння, тым менш успрымальны вірус да вызначанага лекаў.
Гэтыя значэння затым змяшчаюцца ў межах ніжніх-клінічных і верхнія клінічных дыяпазонаў, з верхнімі значэннямі надаваць больш высокі ўзроўню ўстойлівасці да лекавых прэпаратаў. (Глядзі прыклад справаздачы .)
Калі выконваецца тэставы Генетычная супраціў?
У ЗША, тэставанне генетычная ўстойлівасць традыцыйна ажыццяўляецца на лячэнне наіўных пацыентаў, каб вызначыць, ці ёсць у іх «набыты» лекавай устойлівасці. Даследаванні , праведзеныя ў ЗША , паказваюць , што ад 6% да 16% ад перададзенага віруса будуць устойлівыя па меншай меры , аднаго антырэтравіруснае прэпаратаў, у той час як амаль 5% будзе ўстойлівыя да больш чым аднаму класу наркотыкаў.
Генетычнае тэставанне супраціву таксама выкарыстоўваецца, калі лекавая ўстойлівасць падазраецца ў асоб, якія атрымліваюць тэрапію. Выпрабаванне праводзіцца , калі пацыент альбо прымаць памылковы рэжым або ў працягу чатырох тыдняў пасля спынення лячэння , калі вірусная нагрузка перавышае 500 копій / мл. Генотипирование звычайна пераважна ў такіх выпадках, як яны стаяць менш, маюць больш хуткае час апрацоўкі, і прапануюць больш высокую адчувальнасць для выяўлення сумесяў дзікага тыпу і рэзістэнтнасць віруса.
Спалучэнне фенатыпічнае і генатыпічнай тэставання , як правіла , пераважныя для асоб са складанай, множнай лекавай устойлівасці, асабліва для тых , хто падвяргаецца ўздзеянню інгібітараў протеазы .
крыніцы:
Сусветная арганізацыя аховы здароўя (СААЗ). «Супраціў ВІЧ Drug факты.» Жэнева, Швейцарыя; 11 красавіка 2011.
Кім, D.; Зибель, R.; Saduvala, Н.; і іншыя «Trend перадаюцца ВІЧ-1 АРВ Лекавая ўстойлівасць мутацый , звязаных з : 10 абласцей эпідэміялагічнага нагляду за ВІЧ, ЗША, 2007-2010 гг.» Дваццаты канферэнцыя па рэтравіруса і апартуністычных інфекцый. Атланта, штат Джорджыя; 6 сакавіка 2013; Аральны абстрактныя 149.
Нацыянальныя інстытуты здароўя (NIH). «Рэкамендацыі па ўжыванні антырэтравірусных прэпаратаў ў ВІЧ-1-інфіцыраваных дарослых і падлеткаў». Bethesda, Maryland; 11 кастрычніка 2013.